Тестирование на мутации генов PDGFRA: выявление опухолевой подгруппы, которую KIT-тестирование оставляет позади

Обзор

Не каждая опухоль стромала обусловлена KIT, и пациенты, не входящие в эту группу, именно поэтому требуется генотипирование PDGFRA.какие опухоли переносят варианты PDGFRA, где в организме эти опухоли, как правило, возникают, и как в докладе должна быть определена подгруппа, чтобы клиницисты могли действовать в соответствии с ней.

Как это работает

PDGFRA принадлежит к тому же семейству рецепторов, что и KIT, и передает сопоставимые сигналы роста через внутриклеточный домен киназы.который кодирует цикл активации и содержит часто наблюдаемую замену D842VИз-за того, что эти позиции отличаются от горячих точек KIT,запрос только на KIT возвращает отрицательный результат в этой подгруппе, даже если присутствует подлинный драйвер уровня рецептораСеквенирование PDGFRA рядом или сразу после KIT закрывает этот пробел и переклассифицирует опухоли, ранее маркированные как неизвестные.

Показания

Подгруппа, в которой следует уделить приоритетное внимание, хорошо характеризуется: опухоли строма, зарегистрированные как дикий тип KIT, поражения желудка или оментума,и случаи, показывающие морфологию эпителиоза под микроскопомВ тех случаях, когда ткани редки и только один дополнительный тест является реалистичным, эти признаки определяют пациентов, которые с наибольшей вероятностью получат информативный результат PDGFRA.Анализ используется для молекулярной классификации опухоли и следует интерпретировать вместе с гистологией, а не в одиночку..

Спецификации и отчетность

Формалин-фиксированная ткань является стандартным вводом, с лабораторным подтверждением клеточности опухоли перед экстракцией.И в отчете должно быть указано обнаружение экзона 18 D842V явно, а не сложить его в общую категорию экзона 18., поскольку эта специфическая замена определяет отдельную подгруппу внутри подгруппы.

Хранение и поставки

Если PDGFRA выполняет запрос KIT как рефлексное тестирование, практическим ограничением является остаточная ткань, а не температура.Подтвердите с лабораторией, сколько секций может поддерживать один блок и сохраняется ли извлеченная ДНК для запросов ниже по течениюБлоки перемещаются при температуре окружающей среды, в то время как удерживаемая нуклеиновая кислота хранится замороженной.Согласование рефлекторных критериев заранее позволяет избежать второго запроса на образец, который пациент может не быть в состоянии предоставить.

Частые вопросы

Вопрос: Какие пациенты должны быть приоритетными для анализа PDGFRA, когда ткань ограничена?Приоритетное внимание следует уделять случаям дикого типа КИТ, желудочным или оментальным первичным опухолям и опухолям с эпителиоидными признаками.Эти характеристики концентрируют диагностическую производительность, когда можно пощадить только один дополнительный раздел.

Вопрос: Почему замена экзона 18 D842V выделяется в отчетах?Это наиболее часто встречающееся изменение PDGFRA и ведет себя как собственная молекулярная категория, поэтому группировка его под общим названием экзона 18 отбрасывает различие, которое делает результат действенным.

Вопрос: Положительный результат на PDGFRA изменяет классификацию опухоли?Анатомический диагноз остается, но молекулярная классификация и популяция, к которой принадлежит пациент, меняются.